Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms