Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARL1P40616 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARL1P40616 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARL1P40616 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARL1P40616 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARL1P40616 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARL1P40616 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARL1P40616 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARL1P40616 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARL1P40616 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARL1P40616 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARL1P40616 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARL1P40616 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARL1P40616 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARL1P40616 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARL1P40616 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARL1P40616 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARL1P40616 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARL1P40616 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARL1P40616 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARL1P40616 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARL1P40616 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARL1P40616 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARL1P40616 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARL1P40616 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARL1P40616 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARL1P40616 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARL1P40616 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARL1P40616 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARL1P40616 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARL1P40616 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ARL1P40616 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARL1P40616 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARL1P40616 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARL1P40616 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARL1P40616 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARL1P40616 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARL1P40616 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARL1P40616 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARL1P40616 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARL1P40616 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ARL1P40616 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARL1P40616 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARL1P40616 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARL1P40616 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARL1P40616 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARL1P40616 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARL1P40616 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARL1P40616 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARL1P40616 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARL1P40616 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARL1P40616 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARL1P40616 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARL1P40616 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARL1P40616 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARL1P40616 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARL1P40616 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARL1P40616 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARL1P40616 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARL1P40616 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARL1P40616 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ARL1P40616 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARL1P40616 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARL1P40616 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARL1P40616 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARL1P40616 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ARL1P40616 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARL1P40616 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARL1P40616 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARL1P40616 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARL1P40616 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARL1P40616 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ARL1P40616 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARL1P40616 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARL1P40616 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARL1P40616 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ARL1P40616 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARL1P40616 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARL1P40616 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARL1P40616 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARL1P40616 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARL1P40616 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARL1P40616 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARL1P40616 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARL1P40616 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARL1P40616 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARL1P40616 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARL1P40616 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARL1P40616 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARL1P40616 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARL1P40616 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARL1P40616 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARL1P40616 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARL1P40616 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARL1P40616 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARL1P40616 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ARL1P40616 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARL1P40616 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARL1P40616 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARL1P40616 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms