Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms