Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C8orf89P0DMQ9 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms