Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK5

VANGL2, Vang-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VANGL2Q9ULK5 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VANGL2Q9ULK5 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms