Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVK13-1Q9NX77 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVK13-1Q9NX77 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVK13-1Q9NX77 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVK13-1Q9NX77 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVK13-1Q9NX77 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVK13-1Q9NX77 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVK13-1Q9NX77 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVK13-1Q9NX77 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVK13-1Q9NX77 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVK13-1Q9NX77 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVK13-1Q9NX77 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVK13-1Q9NX77 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVK13-1Q9NX77 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVK13-1Q9NX77 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVK13-1Q9NX77 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVK13-1Q9NX77 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVK13-1Q9NX77 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVK13-1Q9NX77 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVK13-1Q9NX77 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVK13-1Q9NX77 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVK13-1Q9NX77 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVK13-1Q9NX77 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVK13-1Q9NX77 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVK13-1Q9NX77 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms