Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms