Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCIRG1Q13488 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms