Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SSBP1Q04837 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SSBP1Q04837 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms