Protein–RNA interactions for Protein: P39905

GDNF, Glial cell line-derived neurotrophic factor, humanhuman

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDNFP39905 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GDNFP39905 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GDNFP39905 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GDNFP39905 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GDNFP39905 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GDNFP39905 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GDNFP39905 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
GDNFP39905 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GDNFP39905 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GDNFP39905 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GDNFP39905 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GDNFP39905 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GDNFP39905 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GDNFP39905 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GDNFP39905 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GDNFP39905 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GDNFP39905 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GDNFP39905 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GDNFP39905 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GDNFP39905 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GDNFP39905 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GDNFP39905 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GDNFP39905 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GDNFP39905 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GDNFP39905 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GDNFP39905 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GDNFP39905 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GDNFP39905 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
GDNFP39905 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GDNFP39905 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GDNFP39905 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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GDNFP39905 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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GDNFP39905 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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GDNFP39905 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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GDNFP39905 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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GDNFP39905 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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GDNFP39905 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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GDNFP39905 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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GDNFP39905 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GDNFP39905 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GDNFP39905 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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