Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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CASQ1P31415 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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CASQ1P31415 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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CASQ1P31415 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
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CASQ1P31415 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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CASQ1P31415 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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