Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CENPBD1B2RD01 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CENPBD1B2RD01 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CENPBD1B2RD01 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CENPBD1B2RD01 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CENPBD1B2RD01 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CENPBD1B2RD01 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPBD1B2RD01 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPBD1B2RD01 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPBD1B2RD01 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPBD1B2RD01 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPBD1B2RD01 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPBD1B2RD01 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPBD1B2RD01 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPBD1B2RD01 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPBD1B2RD01 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPBD1B2RD01 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPBD1B2RD01 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPBD1B2RD01 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPBD1B2RD01 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPBD1B2RD01 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPBD1B2RD01 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPBD1B2RD01 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPBD1B2RD01 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPBD1B2RD01 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPBD1B2RD01 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPBD1B2RD01 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPBD1B2RD01 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPBD1B2RD01 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPBD1B2RD01 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPBD1B2RD01 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPBD1B2RD01 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPBD1B2RD01 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPBD1B2RD01 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPBD1B2RD01 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPBD1B2RD01 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.5 ms