Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,791 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN11AQ9UI33 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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