Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP2

CMC2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC2Q9NRP2 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms