Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP2

CMC2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC2Q9NRP2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CMC2Q9NRP2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CMC2Q9NRP2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CMC2Q9NRP2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CMC2Q9NRP2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CMC2Q9NRP2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CMC2Q9NRP2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CMC2Q9NRP2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CMC2Q9NRP2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CMC2Q9NRP2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CMC2Q9NRP2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CMC2Q9NRP2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CMC2Q9NRP2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CMC2Q9NRP2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CMC2Q9NRP2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CMC2Q9NRP2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CMC2Q9NRP2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CMC2Q9NRP2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CMC2Q9NRP2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CMC2Q9NRP2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CMC2Q9NRP2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CMC2Q9NRP2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CMC2Q9NRP2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CMC2Q9NRP2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CMC2Q9NRP2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CMC2Q9NRP2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CMC2Q9NRP2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CMC2Q9NRP2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CMC2Q9NRP2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CMC2Q9NRP2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CMC2Q9NRP2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CMC2Q9NRP2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CMC2Q9NRP2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CMC2Q9NRP2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CMC2Q9NRP2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CMC2Q9NRP2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CMC2Q9NRP2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CMC2Q9NRP2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CMC2Q9NRP2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CMC2Q9NRP2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CMC2Q9NRP2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CMC2Q9NRP2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CMC2Q9NRP2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CMC2Q9NRP2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CMC2Q9NRP2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CMC2Q9NRP2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CMC2Q9NRP2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CMC2Q9NRP2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CMC2Q9NRP2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CMC2Q9NRP2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CMC2Q9NRP2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CMC2Q9NRP2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CMC2Q9NRP2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CMC2Q9NRP2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CMC2Q9NRP2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CMC2Q9NRP2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CMC2Q9NRP2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CMC2Q9NRP2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CMC2Q9NRP2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CMC2Q9NRP2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CMC2Q9NRP2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CMC2Q9NRP2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CMC2Q9NRP2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CMC2Q9NRP2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CMC2Q9NRP2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CMC2Q9NRP2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CMC2Q9NRP2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CMC2Q9NRP2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CMC2Q9NRP2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CMC2Q9NRP2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CMC2Q9NRP2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CMC2Q9NRP2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CMC2Q9NRP2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CMC2Q9NRP2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CMC2Q9NRP2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CMC2Q9NRP2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CMC2Q9NRP2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CMC2Q9NRP2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CMC2Q9NRP2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CMC2Q9NRP2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CMC2Q9NRP2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CMC2Q9NRP2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CMC2Q9NRP2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CMC2Q9NRP2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CMC2Q9NRP2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CMC2Q9NRP2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CMC2Q9NRP2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CMC2Q9NRP2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CMC2Q9NRP2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CMC2Q9NRP2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CMC2Q9NRP2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CMC2Q9NRP2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CMC2Q9NRP2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CMC2Q9NRP2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CMC2Q9NRP2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CMC2Q9NRP2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CMC2Q9NRP2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CMC2Q9NRP2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CMC2Q9NRP2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CMC2Q9NRP2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms