Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NRIP3Q9NQ35 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms