Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYQ5

DGCR8, Microprocessor complex subunit DGCR8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DGCR8Q8WYQ5 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.762e-6■■■■■ 47.6
DGCR8Q8WYQ5 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.812e-6■■■■■ 47.6
DGCR8Q8WYQ5 KLHL29-204ENST00000489446 2456 ntTSL 1 (best)15.3■□□□□ 0.041e-6■■■■■ 47.5
DGCR8Q8WYQ5 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.023e-7■■■■■ 47.4
DGCR8Q8WYQ5 CD163-205ENST00000537044 5312 ntTSL 29.62□□□□□ -0.879e-7■■■■■ 47.4
DGCR8Q8WYQ5 CD163-203ENST00000432237 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.059e-7■■■■■ 47.4
DGCR8Q8WYQ5 CD163-202ENST00000396620 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.169e-7■■■■■ 47.4
DGCR8Q8WYQ5 CD163-201ENST00000359156 4268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.219e-7■■■■■ 47.4
DGCR8Q8WYQ5 POLR2B-204ENST00000433463 539 ntTSL 321.11■□□□□ 0.974e-12■■■■■ 47.3
DGCR8Q8WYQ5 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.214e-12■■■■■ 47.3
DGCR8Q8WYQ5 POLR2B-206ENST00000450656 608 ntTSL 412.42□□□□□ -0.424e-12■■■■■ 47.3
DGCR8Q8WYQ5 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.284e-12■■■■■ 47.3
DGCR8Q8WYQ5 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.634e-12■■■■■ 47.3
DGCR8Q8WYQ5 POLR2B-211ENST00000497845 551 ntTSL 44.84□□□□□ -1.634e-12■■■■■ 47.3
DGCR8Q8WYQ5 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.684e-12■■■■■ 47.3
DGCR8Q8WYQ5 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.298e-7■■■■■ 47.3
DGCR8Q8WYQ5 NCOA1-211ENST00000496333 501 ntTSL 314.08□□□□□ -0.168e-7■■■■■ 47.3
DGCR8Q8WYQ5 NCOA1-204ENST00000405141 7405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.88e-7■■■■■ 47.3
DGCR8Q8WYQ5 MIR182-201ENST00000385255 110 ntBASIC11.09□□□□□ -0.634e-7■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.193e-6■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.163e-6■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.711e-10■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 ACYP2-205ENST00000458030 1330 ntTSL 323.32■■□□□ 1.321e-6■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.241e-10■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.831e-10■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.491e-10■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.471e-10■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 SGMS1-208ENST00000608287 542 ntTSL 417.93■□□□□ 0.461e-10■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 NAXD-203ENST00000470164 2377 ntTSL 217.34■□□□□ 0.372e-7■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.361e-10■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.292e-7■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.271e-10■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.171e-10■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.121e-10■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.112e-7■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.081e-10■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 SUMF1-204ENST00000448413 3150 ntTSL 215.34■□□□□ 0.059e-7■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.041e-10■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.031e-10■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.051e-10■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.071e-10■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 SGMS1-209ENST00000609445 594 ntTSL 414.32□□□□□ -0.121e-10■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.161e-10■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.181e-10■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 SRP14-202ENST00000558243 770 ntTSL 513.91□□□□□ -0.181e-10■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.21e-10■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 PAM-204ENST00000348126 3622 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.231e-10■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 PAM-202ENST00000345721 3684 ntTSL 213.35□□□□□ -0.271e-10■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.31e-6■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 HSPA8-222ENST00000534319 1884 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.311e-10■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.351e-10■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 HSPA8-201ENST00000227378 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.371e-10■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 BAZ2A-201ENST00000379441 8831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.391e-10■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 HSPA8-203ENST00000524552 963 ntTSL 1 (best)12.58□□□□□ -0.41e-10■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 DNM2-207ENST00000586939 551 ntTSL 412.55□□□□□ -0.41e-10■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 HSPA8-207ENST00000526110 1924 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.431e-10■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 ABCA8-208ENST00000586539 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.431e-6■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 THBS1-201ENST00000260356 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.491e-6■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 HSPA8-215ENST00000532091 2301 ntTSL 512□□□□□ -0.491e-10■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 HSPA8-218ENST00000532636 2306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51e-10■■■■■ 47.2
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DGCR8Q8WYQ5 SRP14-203ENST00000558527 791 ntTSL 211.15□□□□□ -0.621e-10■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 BAZ2A-214ENST00000551812 8600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.641e-10■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 BAZ2A-211ENST00000549884 6050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.671e-10■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 ABCA8-203ENST00000430352 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.781e-6■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 BAZ2A-213ENST00000551759 833 ntTSL 59.98□□□□□ -0.811e-10■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 SRP14-207ENST00000559475 463 ntTSL 29.74□□□□□ -0.851e-10■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 SRP14-205ENST00000559081 578 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.911e-10■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 PAM-205ENST00000379799 2567 ntTSL 57.9□□□□□ -1.141e-10■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 P3H2-207ENST00000470925 583 ntTSL 47.28□□□□□ -1.241e-10■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 SRP14-206ENST00000559439 743 ntTSL 36.66□□□□□ -1.341e-10■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 ABCA8-204ENST00000541225 3657 ntTSL 25.59□□□□□ -1.521e-6■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.581e-6■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.611e-6■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.711e-10■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 SGMS1-205ENST00000498514 397 ntTSL 30.19□□□□□ -2.381e-10■■■■■ 47.2
DGCR8Q8WYQ5 MCTP2-204ENST00000456504 4493 ntTSL 1 (best)11.13□□□□□ -0.632e-6■■■■■ 47.1
DGCR8Q8WYQ5 TMOD3-201ENST00000308580 8255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.732e-7■■■■■ 47.1
DGCR8Q8WYQ5 KLF13-206ENST00000558921 440 ntTSL 324.74■■□□□ 1.552e-6■■■■■ 47.1
DGCR8Q8WYQ5 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.722e-6■■■■■ 47.1
DGCR8Q8WYQ5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 47.1
DGCR8Q8WYQ5 P3H2-201ENST00000319332 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 47
DGCR8Q8WYQ5 P3H2-203ENST00000427335 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.152e-6■■■■■ 47
DGCR8Q8WYQ5 TCF25-222ENST00000568412 797 ntTSL 314.17□□□□□ -0.145e-7■■■■■ 47
DGCR8Q8WYQ5 TCF25-223ENST00000568870 263 ntTSL 213.74□□□□□ -0.215e-7■■■■■ 47
DGCR8Q8WYQ5 TCF25-219ENST00000566751 383 ntTSL 57.89□□□□□ -1.155e-7■■■■■ 47
DGCR8Q8WYQ5 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.262e-6■■■■■ 46.9
DGCR8Q8WYQ5 SLC8B1-208ENST00000549372 555 ntTSL 58.08□□□□□ -1.125e-7■■■■■ 46.9
DGCR8Q8WYQ5 MYO9B-209ENST00000597073 2087 ntTSL 521.71■■□□□ 1.071e-11■■■■■ 46.8
DGCR8Q8WYQ5 MYO9B-208ENST00000596942 584 ntTSL 517.22■□□□□ 0.351e-11■■■■■ 46.8
DGCR8Q8WYQ5 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 46.8
DGCR8Q8WYQ5 MYO9B-213ENST00000598419 544 ntTSL 516.53■□□□□ 0.241e-11■■■■■ 46.8
DGCR8Q8WYQ5 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 46.8
DGCR8Q8WYQ5 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 46.8
DGCR8Q8WYQ5 TNRC6B-203ENST00000402203 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.163e-6■■■■■ 46.8
DGCR8Q8WYQ5 PISD-202ENST00000382151 2669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.231e-7■■■■■ 46.8
DGCR8Q8WYQ5 HDAC8-205ENST00000373568 1037 ntTSL 512.64□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 46.8
DGCR8Q8WYQ5 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.463e-6■■■■■ 46.8
DGCR8Q8WYQ5 C3-210ENST00000598805 873 ntTSL 213.26□□□□□ -0.291e-7■■■■■ 46.8
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