RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433463.1

POLR2B-204, Transcript of RNA polymerase II subunit B, humanhuman

TSL 3

Gene POLR2B, Length 539 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2B-204ENST00000433463 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.8■■■■■ 6.84
POLR2B-204ENST00000433463 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.71■■■■■ 5.87
POLR2B-204ENST00000433463 ABCC9O60706 1549 aa51.5■■■■■ 5.84
POLR2B-204ENST00000433463 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.15■■■■■ 5.46
POLR2B-204ENST00000433463 NACADO15069 1562 aa48.89■■■■■ 5.42
POLR2B-204ENST00000433463 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.87■■■■■ 5.41
POLR2B-204ENST00000433463 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.28■■■■■ 5.32
POLR2B-204ENST00000433463 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.04■■■■■ 5.28
POLR2B-204ENST00000433463 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.03■■■■■ 5.28
POLR2B-204ENST00000433463 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.93■■■■■ 5.26
POLR2B-204ENST00000433463 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.92■■■■■ 5.26
POLR2B-204ENST00000433463 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.76■■■■■ 5.24
POLR2B-204ENST00000433463 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.61■■■■■ 5.21
POLR2B-204ENST00000433463 SCRIBQ14160 1630 aa47.15■■■■■ 5.14
POLR2B-204ENST00000433463 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.09■■■■■ 5.13
POLR2B-204ENST00000433463 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.5■■■■■ 5.04
POLR2B-204ENST00000433463 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.47■■■■■ 5.03
POLR2B-204ENST00000433463 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.38■■■■■ 5.01
POLR2B-204ENST00000433463 NCAPD3P42695 1498 aa45.12■■■■■ 4.81
POLR2B-204ENST00000433463 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.01■■■■■ 4.8
POLR2B-204ENST00000433463 SMARCA4P51532 1647 aa45.01■■■■■ 4.8
POLR2B-204ENST00000433463 SMARCA2P51531 1590 aa44.94■■■■■ 4.78
POLR2B-204ENST00000433463 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.87■■■■■ 4.77
POLR2B-204ENST00000433463 HMGXB3Q12766 1538 aa44.78■■■■■ 4.76
POLR2B-204ENST00000433463 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.63■■■■■ 4.73
POLR2B-204ENST00000433463 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.55■■■■■ 4.72
POLR2B-204ENST00000433463 ERCC6Q03468 1493 aa44.52■■■■■ 4.72
POLR2B-204ENST00000433463 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.52■■■■■ 4.72
POLR2B-204ENST00000433463 CUX2O14529 1486 aa44.29■■■■■ 4.68
POLR2B-204ENST00000433463 NESP48681 1621 aa44.28■■■■■ 4.68
POLR2B-204ENST00000433463 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.06■■■■■ 4.64
POLR2B-204ENST00000433463 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.99■■■■■ 4.63
POLR2B-204ENST00000433463 WIZO95785 1651 aa43.98■■■■■ 4.63
POLR2B-204ENST00000433463 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.87■■■■■ 4.61
POLR2B-204ENST00000433463 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.8■■■■■ 4.6
POLR2B-204ENST00000433463 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.73■■■■■ 4.59
POLR2B-204ENST00000433463 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.72■■■■■ 4.59
POLR2B-204ENST00000433463 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.69■■■■■ 4.58
POLR2B-204ENST00000433463 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.48■■■■■ 4.55
POLR2B-204ENST00000433463 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.4■■■■■ 4.54
POLR2B-204ENST00000433463 CFTRP13569 1480 aa43.32■■■■■ 4.52
POLR2B-204ENST00000433463 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.31■■■■■ 4.52
POLR2B-204ENST00000433463 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.28■■■■■ 4.52
POLR2B-204ENST00000433463 WDR62O43379 1518 aa43.24■■■■■ 4.51
POLR2B-204ENST00000433463 CCDC88BA6NC98 1476 aa43■■■■■ 4.47
POLR2B-204ENST00000433463 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.85■■■■■ 4.45
POLR2B-204ENST00000433463 PRDM2Q13029 1718 aa42.85■■■■■ 4.45
POLR2B-204ENST00000433463 ABCC8Q09428 1581 aa42.48■■■■■ 4.39
POLR2B-204ENST00000433463 TOPBP1Q92547 1522 aa42.46■■■■■ 4.39
POLR2B-204ENST00000433463 IFT140Q96RY7 1462 aa42.44■■■■■ 4.38
POLR2B-204ENST00000433463 OSCARQ8IYS5 282 aa42.43■■■■■ 4.38
POLR2B-204ENST00000433463 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.34■■■■■ 4.37
POLR2B-204ENST00000433463 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.28■■■■■ 4.36
POLR2B-204ENST00000433463 TRIM41Q8WV44 630 aa42.23■■■■■ 4.35
POLR2B-204ENST00000433463 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.13■■■■■ 4.33
POLR2B-204ENST00000433463 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.05■■■■■ 4.32
POLR2B-204ENST00000433463 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.04■■■■■ 4.32
POLR2B-204ENST00000433463 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.02■■■■■ 4.32
POLR2B-204ENST00000433463 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.98■■■■■ 4.312e-6■■■■□ 23.4
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POLR2B-204ENST00000433463 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.89■■■■■ 4.3
POLR2B-204ENST00000433463 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.83■■■■■ 4.29
POLR2B-204ENST00000433463 CUX1P39880 1505 aa41.8■■■■■ 4.28
POLR2B-204ENST00000433463 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.79■■■■■ 4.28
POLR2B-204ENST00000433463 FBLN2P98095 1184 aa41.79■■■■■ 4.28
POLR2B-204ENST00000433463 CHD1O14646 1710 aa41.68■■■■■ 4.26
POLR2B-204ENST00000433463 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.68■■■■■ 4.26
POLR2B-204ENST00000433463 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.68■■■■■ 4.26
POLR2B-204ENST00000433463 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.68■■■■■ 4.26
POLR2B-204ENST00000433463 WDR97A6NE52 1622 aa41.67■■■■■ 4.26
POLR2B-204ENST00000433463 ARHGEF11O15085 1522 aa41.6■■■■■ 4.25
POLR2B-204ENST00000433463 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.54■■■■■ 4.24
POLR2B-204ENST00000433463 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.52■■■■■ 4.24
POLR2B-204ENST00000433463 GRIN2BQ13224 1484 aa41.52■■■■■ 4.24
POLR2B-204ENST00000433463 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.48■■■■■ 4.23
POLR2B-204ENST00000433463 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.41■■■■■ 4.22
POLR2B-204ENST00000433463 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.4■■■■■ 4.22
POLR2B-204ENST00000433463 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.38■■■■■ 4.21
POLR2B-204ENST00000433463 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.34■■■■■ 4.21
POLR2B-204ENST00000433463 SYNJ2O15056 1496 aa41.34■■■■■ 4.21
POLR2B-204ENST00000433463 SYNJ1O43426 1573 aa41.29■■■■■ 4.2
POLR2B-204ENST00000433463 PBRM1Q86U86 1689 aa41.29■■■■■ 4.2
POLR2B-204ENST00000433463 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.23■■■■■ 4.19
POLR2B-204ENST00000433463 TOP2BQ02880 1626 aa41.22■■■■■ 4.19
POLR2B-204ENST00000433463 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.2■■■■■ 4.19
POLR2B-204ENST00000433463 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.2■■■■■ 4.19
POLR2B-204ENST00000433463 ARAP1Q96P48 1450 aa41.18■■■■■ 4.18
POLR2B-204ENST00000433463 GRIN2AQ12879 1464 aa40.95■■■■■ 4.15
POLR2B-204ENST00000433463 ADAMTS12P58397 1594 aa40.91■■■■■ 4.14
POLR2B-204ENST00000433463 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.91■■■■■ 4.14
POLR2B-204ENST00000433463 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.91■■■■■ 4.14
POLR2B-204ENST00000433463 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.88■■■■■ 4.13
POLR2B-204ENST00000433463 NUP160Q12769 1436 aa40.78■■■■■ 4.12
POLR2B-204ENST00000433463 CEP170Q5SW79 1584 aa40.74■■■■■ 4.11
POLR2B-204ENST00000433463 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.56■■■■■ 4.08
POLR2B-204ENST00000433463 SHROOM2Q13796 1616 aa40.53■■■■■ 4.08
POLR2B-204ENST00000433463 KIF27Q86VH2 1401 aa40.53■■■■■ 4.08
POLR2B-204ENST00000433463 JPH4Q96JJ6 628 aa40.49■■■■■ 4.07
POLR2B-204ENST00000433463 IGF1RP08069 1367 aa40.44■■■■■ 4.06
POLR2B-204ENST00000433463 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.43■■■■■ 4.06
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