Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms