Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms