Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms