Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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SYCP1Q15431 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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