Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms