Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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SNX13Q9Y5W8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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SNX13Q9Y5W8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
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SNX13Q9Y5W8 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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SNX13Q9Y5W8 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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SNX13Q9Y5W8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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SNX13Q9Y5W8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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SNX13Q9Y5W8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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SNX13Q9Y5W8 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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SNX13Q9Y5W8 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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SNX13Q9Y5W8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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SNX13Q9Y5W8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
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SNX13Q9Y5W8 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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