Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.15
TNFSF18Q9UNG2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TNFSF18Q9UNG2 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TNFSF18Q9UNG2 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TNFSF18Q9UNG2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TNFSF18Q9UNG2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TNFSF18Q9UNG2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TNFSF18Q9UNG2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TNFSF18Q9UNG2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TNFSF18Q9UNG2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
TNFSF18Q9UNG2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TNFSF18Q9UNG2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
TNFSF18Q9UNG2 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
TNFSF18Q9UNG2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TNFSF18Q9UNG2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TNFSF18Q9UNG2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TNFSF18Q9UNG2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
TNFSF18Q9UNG2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TNFSF18Q9UNG2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
TNFSF18Q9UNG2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TNFSF18Q9UNG2 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TNFSF18Q9UNG2 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TNFSF18Q9UNG2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TNFSF18Q9UNG2 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TNFSF18Q9UNG2 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TNFSF18Q9UNG2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TNFSF18Q9UNG2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TNFSF18Q9UNG2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TNFSF18Q9UNG2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TNFSF18Q9UNG2 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TNFSF18Q9UNG2 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TNFSF18Q9UNG2 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TNFSF18Q9UNG2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TNFSF18Q9UNG2 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TNFSF18Q9UNG2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TNFSF18Q9UNG2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TNFSF18Q9UNG2 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TNFSF18Q9UNG2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TNFSF18Q9UNG2 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TNFSF18Q9UNG2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TNFSF18Q9UNG2 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TNFSF18Q9UNG2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms