Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PARVAQ9NVD7 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms