Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF18Q96CE8 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms