Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L2Q8NAA4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms