Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms