Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms