Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA8P53708 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms