Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNA2P51530 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNA2P51530 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNA2P51530 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNA2P51530 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNA2P51530 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNA2P51530 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNA2P51530 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DNA2P51530 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DNA2P51530 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNA2P51530 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNA2P51530 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNA2P51530 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNA2P51530 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNA2P51530 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNA2P51530 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNA2P51530 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNA2P51530 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNA2P51530 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNA2P51530 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNA2P51530 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNA2P51530 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNA2P51530 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNA2P51530 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNA2P51530 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNA2P51530 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNA2P51530 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNA2P51530 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNA2P51530 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNA2P51530 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNA2P51530 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNA2P51530 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DNA2P51530 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNA2P51530 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNA2P51530 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DNA2P51530 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNA2P51530 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNA2P51530 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNA2P51530 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DNA2P51530 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNA2P51530 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNA2P51530 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNA2P51530 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNA2P51530 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNA2P51530 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNA2P51530 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNA2P51530 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNA2P51530 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNA2P51530 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNA2P51530 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNA2P51530 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNA2P51530 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNA2P51530 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNA2P51530 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNA2P51530 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNA2P51530 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNA2P51530 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNA2P51530 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DNA2P51530 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNA2P51530 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNA2P51530 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNA2P51530 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNA2P51530 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNA2P51530 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNA2P51530 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DNA2P51530 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNA2P51530 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNA2P51530 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNA2P51530 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNA2P51530 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNA2P51530 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DNA2P51530 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNA2P51530 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNA2P51530 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNA2P51530 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNA2P51530 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNA2P51530 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNA2P51530 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNA2P51530 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNA2P51530 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNA2P51530 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNA2P51530 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNA2P51530 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNA2P51530 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNA2P51530 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DNA2P51530 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNA2P51530 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNA2P51530 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNA2P51530 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNA2P51530 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNA2P51530 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNA2P51530 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNA2P51530 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNA2P51530 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNA2P51530 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNA2P51530 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNA2P51530 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNA2P51530 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNA2P51530 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DNA2P51530 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms