Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGCP20142 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGCP20142 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGCP20142 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGCP20142 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGCP20142 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGCP20142 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGCP20142 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGCP20142 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGCP20142 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGCP20142 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGCP20142 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGCP20142 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGCP20142 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGCP20142 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGCP20142 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGCP20142 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGCP20142 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGCP20142 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGCP20142 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGCP20142 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGCP20142 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGCP20142 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGCP20142 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGCP20142 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PGCP20142 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PGCP20142 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGCP20142 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGCP20142 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGCP20142 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGCP20142 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGCP20142 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGCP20142 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGCP20142 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGCP20142 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGCP20142 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGCP20142 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGCP20142 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGCP20142 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PGCP20142 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGCP20142 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGCP20142 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PGCP20142 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PGCP20142 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
PGCP20142 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PGCP20142 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PGCP20142 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PGCP20142 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PGCP20142 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGCP20142 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGCP20142 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGCP20142 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGCP20142 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGCP20142 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGCP20142 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGCP20142 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGCP20142 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGCP20142 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGCP20142 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGCP20142 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGCP20142 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGCP20142 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGCP20142 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGCP20142 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGCP20142 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGCP20142 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGCP20142 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGCP20142 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PGCP20142 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGCP20142 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGCP20142 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGCP20142 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGCP20142 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGCP20142 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGCP20142 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGCP20142 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PGCP20142 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGCP20142 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGCP20142 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGCP20142 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGCP20142 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGCP20142 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGCP20142 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGCP20142 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGCP20142 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGCP20142 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGCP20142 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGCP20142 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGCP20142 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGCP20142 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGCP20142 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGCP20142 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGCP20142 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGCP20142 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGCP20142 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGCP20142 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGCP20142 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGCP20142 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGCP20142 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGCP20142 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms