Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EFCAB5A4FU69 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms