Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX8Q9Y5X2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX8Q9Y5X2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX8Q9Y5X2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX8Q9Y5X2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX8Q9Y5X2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX8Q9Y5X2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX8Q9Y5X2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX8Q9Y5X2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX8Q9Y5X2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX8Q9Y5X2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX8Q9Y5X2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX8Q9Y5X2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX8Q9Y5X2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX8Q9Y5X2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX8Q9Y5X2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX8Q9Y5X2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX8Q9Y5X2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX8Q9Y5X2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX8Q9Y5X2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX8Q9Y5X2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX8Q9Y5X2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX8Q9Y5X2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX8Q9Y5X2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX8Q9Y5X2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX8Q9Y5X2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX8Q9Y5X2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX8Q9Y5X2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNX8Q9Y5X2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX8Q9Y5X2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX8Q9Y5X2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX8Q9Y5X2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX8Q9Y5X2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX8Q9Y5X2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX8Q9Y5X2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX8Q9Y5X2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX8Q9Y5X2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX8Q9Y5X2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX8Q9Y5X2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX8Q9Y5X2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX8Q9Y5X2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX8Q9Y5X2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX8Q9Y5X2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX8Q9Y5X2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX8Q9Y5X2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX8Q9Y5X2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX8Q9Y5X2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX8Q9Y5X2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX8Q9Y5X2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX8Q9Y5X2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX8Q9Y5X2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX8Q9Y5X2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX8Q9Y5X2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX8Q9Y5X2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX8Q9Y5X2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX8Q9Y5X2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX8Q9Y5X2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX8Q9Y5X2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX8Q9Y5X2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX8Q9Y5X2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX8Q9Y5X2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX8Q9Y5X2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX8Q9Y5X2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX8Q9Y5X2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX8Q9Y5X2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX8Q9Y5X2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX8Q9Y5X2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX8Q9Y5X2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX8Q9Y5X2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX8Q9Y5X2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX8Q9Y5X2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX8Q9Y5X2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX8Q9Y5X2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX8Q9Y5X2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX8Q9Y5X2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX8Q9Y5X2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX8Q9Y5X2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX8Q9Y5X2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX8Q9Y5X2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX8Q9Y5X2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX8Q9Y5X2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX8Q9Y5X2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX8Q9Y5X2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX8Q9Y5X2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX8Q9Y5X2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX8Q9Y5X2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX8Q9Y5X2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX8Q9Y5X2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX8Q9Y5X2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX8Q9Y5X2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX8Q9Y5X2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX8Q9Y5X2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX8Q9Y5X2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX8Q9Y5X2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX8Q9Y5X2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX8Q9Y5X2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX8Q9Y5X2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX8Q9Y5X2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX8Q9Y5X2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX8Q9Y5X2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms