Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NINLQ9Y2I6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NINLQ9Y2I6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NINLQ9Y2I6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
NINLQ9Y2I6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NINLQ9Y2I6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
NINLQ9Y2I6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NINLQ9Y2I6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NINLQ9Y2I6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NINLQ9Y2I6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NINLQ9Y2I6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
NINLQ9Y2I6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NINLQ9Y2I6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NINLQ9Y2I6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
NINLQ9Y2I6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NINLQ9Y2I6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NINLQ9Y2I6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NINLQ9Y2I6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NINLQ9Y2I6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
NINLQ9Y2I6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NINLQ9Y2I6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NINLQ9Y2I6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NINLQ9Y2I6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NINLQ9Y2I6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NINLQ9Y2I6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NINLQ9Y2I6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
NINLQ9Y2I6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
NINLQ9Y2I6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NINLQ9Y2I6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NINLQ9Y2I6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NINLQ9Y2I6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NINLQ9Y2I6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NINLQ9Y2I6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NINLQ9Y2I6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NINLQ9Y2I6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NINLQ9Y2I6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NINLQ9Y2I6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NINLQ9Y2I6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NINLQ9Y2I6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NINLQ9Y2I6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NINLQ9Y2I6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
NINLQ9Y2I6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NINLQ9Y2I6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NINLQ9Y2I6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NINLQ9Y2I6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NINLQ9Y2I6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NINLQ9Y2I6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NINLQ9Y2I6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NINLQ9Y2I6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NINLQ9Y2I6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
NINLQ9Y2I6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NINLQ9Y2I6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NINLQ9Y2I6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NINLQ9Y2I6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NINLQ9Y2I6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NINLQ9Y2I6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NINLQ9Y2I6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
NINLQ9Y2I6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NINLQ9Y2I6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NINLQ9Y2I6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NINLQ9Y2I6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NINLQ9Y2I6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NINLQ9Y2I6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
NINLQ9Y2I6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NINLQ9Y2I6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
NINLQ9Y2I6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
NINLQ9Y2I6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
NINLQ9Y2I6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NINLQ9Y2I6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NINLQ9Y2I6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NINLQ9Y2I6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NINLQ9Y2I6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NINLQ9Y2I6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NINLQ9Y2I6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NINLQ9Y2I6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NINLQ9Y2I6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NINLQ9Y2I6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NINLQ9Y2I6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NINLQ9Y2I6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NINLQ9Y2I6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NINLQ9Y2I6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NINLQ9Y2I6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
NINLQ9Y2I6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NINLQ9Y2I6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NINLQ9Y2I6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NINLQ9Y2I6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
NINLQ9Y2I6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NINLQ9Y2I6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
NINLQ9Y2I6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
NINLQ9Y2I6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
NINLQ9Y2I6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NINLQ9Y2I6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NINLQ9Y2I6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NINLQ9Y2I6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NINLQ9Y2I6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NINLQ9Y2I6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NINLQ9Y2I6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NINLQ9Y2I6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NINLQ9Y2I6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NINLQ9Y2I6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms