Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2A7

NCKAP1, Nck-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1Q9Y2A7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCKAP1Q9Y2A7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCKAP1Q9Y2A7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCKAP1Q9Y2A7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCKAP1Q9Y2A7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCKAP1Q9Y2A7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCKAP1Q9Y2A7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCKAP1Q9Y2A7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCKAP1Q9Y2A7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCKAP1Q9Y2A7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCKAP1Q9Y2A7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCKAP1Q9Y2A7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCKAP1Q9Y2A7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCKAP1Q9Y2A7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCKAP1Q9Y2A7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCKAP1Q9Y2A7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCKAP1Q9Y2A7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCKAP1Q9Y2A7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCKAP1Q9Y2A7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCKAP1Q9Y2A7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCKAP1Q9Y2A7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NCKAP1Q9Y2A7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCKAP1Q9Y2A7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCKAP1Q9Y2A7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCKAP1Q9Y2A7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCKAP1Q9Y2A7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCKAP1Q9Y2A7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCKAP1Q9Y2A7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCKAP1Q9Y2A7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NCKAP1Q9Y2A7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCKAP1Q9Y2A7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCKAP1Q9Y2A7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCKAP1Q9Y2A7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCKAP1Q9Y2A7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCKAP1Q9Y2A7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCKAP1Q9Y2A7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCKAP1Q9Y2A7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCKAP1Q9Y2A7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCKAP1Q9Y2A7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCKAP1Q9Y2A7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NCKAP1Q9Y2A7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCKAP1Q9Y2A7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCKAP1Q9Y2A7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCKAP1Q9Y2A7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCKAP1Q9Y2A7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCKAP1Q9Y2A7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCKAP1Q9Y2A7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCKAP1Q9Y2A7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCKAP1Q9Y2A7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCKAP1Q9Y2A7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCKAP1Q9Y2A7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCKAP1Q9Y2A7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCKAP1Q9Y2A7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCKAP1Q9Y2A7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NCKAP1Q9Y2A7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCKAP1Q9Y2A7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCKAP1Q9Y2A7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCKAP1Q9Y2A7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCKAP1Q9Y2A7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCKAP1Q9Y2A7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCKAP1Q9Y2A7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCKAP1Q9Y2A7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NCKAP1Q9Y2A7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCKAP1Q9Y2A7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCKAP1Q9Y2A7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCKAP1Q9Y2A7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCKAP1Q9Y2A7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCKAP1Q9Y2A7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCKAP1Q9Y2A7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCKAP1Q9Y2A7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCKAP1Q9Y2A7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCKAP1Q9Y2A7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCKAP1Q9Y2A7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCKAP1Q9Y2A7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCKAP1Q9Y2A7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCKAP1Q9Y2A7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCKAP1Q9Y2A7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCKAP1Q9Y2A7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCKAP1Q9Y2A7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCKAP1Q9Y2A7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCKAP1Q9Y2A7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCKAP1Q9Y2A7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NCKAP1Q9Y2A7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCKAP1Q9Y2A7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCKAP1Q9Y2A7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NCKAP1Q9Y2A7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCKAP1Q9Y2A7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCKAP1Q9Y2A7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCKAP1Q9Y2A7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCKAP1Q9Y2A7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCKAP1Q9Y2A7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCKAP1Q9Y2A7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCKAP1Q9Y2A7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCKAP1Q9Y2A7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCKAP1Q9Y2A7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NCKAP1Q9Y2A7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NCKAP1Q9Y2A7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCKAP1Q9Y2A7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCKAP1Q9Y2A7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCKAP1Q9Y2A7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms