Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GINS2Q9Y248 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GINS2Q9Y248 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GINS2Q9Y248 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GINS2Q9Y248 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GINS2Q9Y248 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GINS2Q9Y248 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GINS2Q9Y248 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GINS2Q9Y248 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GINS2Q9Y248 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GINS2Q9Y248 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GINS2Q9Y248 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GINS2Q9Y248 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GINS2Q9Y248 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GINS2Q9Y248 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GINS2Q9Y248 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GINS2Q9Y248 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GINS2Q9Y248 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GINS2Q9Y248 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GINS2Q9Y248 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GINS2Q9Y248 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GINS2Q9Y248 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GINS2Q9Y248 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GINS2Q9Y248 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GINS2Q9Y248 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GINS2Q9Y248 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GINS2Q9Y248 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GINS2Q9Y248 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GINS2Q9Y248 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GINS2Q9Y248 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GINS2Q9Y248 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GINS2Q9Y248 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GINS2Q9Y248 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GINS2Q9Y248 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GINS2Q9Y248 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GINS2Q9Y248 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GINS2Q9Y248 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GINS2Q9Y248 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GINS2Q9Y248 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
GINS2Q9Y248 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GINS2Q9Y248 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GINS2Q9Y248 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GINS2Q9Y248 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
GINS2Q9Y248 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GINS2Q9Y248 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GINS2Q9Y248 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GINS2Q9Y248 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GINS2Q9Y248 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GINS2Q9Y248 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GINS2Q9Y248 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GINS2Q9Y248 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GINS2Q9Y248 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GINS2Q9Y248 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GINS2Q9Y248 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GINS2Q9Y248 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GINS2Q9Y248 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
GINS2Q9Y248 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GINS2Q9Y248 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GINS2Q9Y248 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GINS2Q9Y248 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GINS2Q9Y248 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GINS2Q9Y248 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GINS2Q9Y248 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GINS2Q9Y248 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GINS2Q9Y248 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GINS2Q9Y248 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GINS2Q9Y248 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GINS2Q9Y248 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GINS2Q9Y248 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GINS2Q9Y248 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GINS2Q9Y248 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GINS2Q9Y248 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GINS2Q9Y248 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GINS2Q9Y248 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GINS2Q9Y248 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GINS2Q9Y248 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GINS2Q9Y248 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GINS2Q9Y248 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
GINS2Q9Y248 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GINS2Q9Y248 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GINS2Q9Y248 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GINS2Q9Y248 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GINS2Q9Y248 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GINS2Q9Y248 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GINS2Q9Y248 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GINS2Q9Y248 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GINS2Q9Y248 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GINS2Q9Y248 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GINS2Q9Y248 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GINS2Q9Y248 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GINS2Q9Y248 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
GINS2Q9Y248 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GINS2Q9Y248 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GINS2Q9Y248 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GINS2Q9Y248 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GINS2Q9Y248 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GINS2Q9Y248 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GINS2Q9Y248 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GINS2Q9Y248 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GINS2Q9Y248 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms