Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGSF9BQ9UPX0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGSF9BQ9UPX0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IGSF9BQ9UPX0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IGSF9BQ9UPX0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IGSF9BQ9UPX0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IGSF9BQ9UPX0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IGSF9BQ9UPX0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGSF9BQ9UPX0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGSF9BQ9UPX0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGSF9BQ9UPX0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGSF9BQ9UPX0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGSF9BQ9UPX0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGSF9BQ9UPX0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGSF9BQ9UPX0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGSF9BQ9UPX0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IGSF9BQ9UPX0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IGSF9BQ9UPX0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IGSF9BQ9UPX0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IGSF9BQ9UPX0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
IGSF9BQ9UPX0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IGSF9BQ9UPX0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IGSF9BQ9UPX0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IGSF9BQ9UPX0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IGSF9BQ9UPX0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IGSF9BQ9UPX0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IGSF9BQ9UPX0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IGSF9BQ9UPX0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IGSF9BQ9UPX0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IGSF9BQ9UPX0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IGSF9BQ9UPX0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IGSF9BQ9UPX0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IGSF9BQ9UPX0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IGSF9BQ9UPX0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IGSF9BQ9UPX0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IGSF9BQ9UPX0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IGSF9BQ9UPX0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IGSF9BQ9UPX0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IGSF9BQ9UPX0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IGSF9BQ9UPX0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IGSF9BQ9UPX0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IGSF9BQ9UPX0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IGSF9BQ9UPX0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IGSF9BQ9UPX0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IGSF9BQ9UPX0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IGSF9BQ9UPX0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IGSF9BQ9UPX0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IGSF9BQ9UPX0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IGSF9BQ9UPX0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IGSF9BQ9UPX0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IGSF9BQ9UPX0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IGSF9BQ9UPX0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IGSF9BQ9UPX0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IGSF9BQ9UPX0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IGSF9BQ9UPX0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IGSF9BQ9UPX0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IGSF9BQ9UPX0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IGSF9BQ9UPX0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IGSF9BQ9UPX0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IGSF9BQ9UPX0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IGSF9BQ9UPX0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IGSF9BQ9UPX0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IGSF9BQ9UPX0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IGSF9BQ9UPX0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IGSF9BQ9UPX0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IGSF9BQ9UPX0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IGSF9BQ9UPX0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
IGSF9BQ9UPX0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IGSF9BQ9UPX0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IGSF9BQ9UPX0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IGSF9BQ9UPX0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IGSF9BQ9UPX0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IGSF9BQ9UPX0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IGSF9BQ9UPX0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IGSF9BQ9UPX0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IGSF9BQ9UPX0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
IGSF9BQ9UPX0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IGSF9BQ9UPX0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IGSF9BQ9UPX0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IGSF9BQ9UPX0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IGSF9BQ9UPX0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IGSF9BQ9UPX0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IGSF9BQ9UPX0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
IGSF9BQ9UPX0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IGSF9BQ9UPX0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
IGSF9BQ9UPX0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IGSF9BQ9UPX0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IGSF9BQ9UPX0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IGSF9BQ9UPX0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IGSF9BQ9UPX0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
IGSF9BQ9UPX0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IGSF9BQ9UPX0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IGSF9BQ9UPX0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IGSF9BQ9UPX0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IGSF9BQ9UPX0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
IGSF9BQ9UPX0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IGSF9BQ9UPX0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IGSF9BQ9UPX0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms