Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV7

PHF24, PHD finger protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF24Q9UPV7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PHF24Q9UPV7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PHF24Q9UPV7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PHF24Q9UPV7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PHF24Q9UPV7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PHF24Q9UPV7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHF24Q9UPV7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHF24Q9UPV7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHF24Q9UPV7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHF24Q9UPV7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHF24Q9UPV7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHF24Q9UPV7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PHF24Q9UPV7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PHF24Q9UPV7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHF24Q9UPV7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHF24Q9UPV7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHF24Q9UPV7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHF24Q9UPV7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHF24Q9UPV7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHF24Q9UPV7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHF24Q9UPV7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHF24Q9UPV7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHF24Q9UPV7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PHF24Q9UPV7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PHF24Q9UPV7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PHF24Q9UPV7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PHF24Q9UPV7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PHF24Q9UPV7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PHF24Q9UPV7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PHF24Q9UPV7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PHF24Q9UPV7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHF24Q9UPV7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHF24Q9UPV7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHF24Q9UPV7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHF24Q9UPV7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PHF24Q9UPV7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PHF24Q9UPV7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PHF24Q9UPV7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHF24Q9UPV7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHF24Q9UPV7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHF24Q9UPV7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PHF24Q9UPV7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PHF24Q9UPV7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHF24Q9UPV7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHF24Q9UPV7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHF24Q9UPV7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHF24Q9UPV7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHF24Q9UPV7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHF24Q9UPV7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHF24Q9UPV7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHF24Q9UPV7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHF24Q9UPV7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHF24Q9UPV7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PHF24Q9UPV7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
PHF24Q9UPV7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHF24Q9UPV7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHF24Q9UPV7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHF24Q9UPV7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHF24Q9UPV7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHF24Q9UPV7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHF24Q9UPV7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHF24Q9UPV7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHF24Q9UPV7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PHF24Q9UPV7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHF24Q9UPV7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHF24Q9UPV7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PHF24Q9UPV7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHF24Q9UPV7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHF24Q9UPV7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHF24Q9UPV7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHF24Q9UPV7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHF24Q9UPV7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHF24Q9UPV7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PHF24Q9UPV7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PHF24Q9UPV7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PHF24Q9UPV7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PHF24Q9UPV7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PHF24Q9UPV7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHF24Q9UPV7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHF24Q9UPV7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHF24Q9UPV7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHF24Q9UPV7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PHF24Q9UPV7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHF24Q9UPV7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PHF24Q9UPV7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHF24Q9UPV7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PHF24Q9UPV7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PHF24Q9UPV7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PHF24Q9UPV7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHF24Q9UPV7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PHF24Q9UPV7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHF24Q9UPV7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHF24Q9UPV7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PHF24Q9UPV7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PHF24Q9UPV7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHF24Q9UPV7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHF24Q9UPV7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHF24Q9UPV7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHF24Q9UPV7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHF24Q9UPV7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms