Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU5

USP24, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 24, humanhuman

Predictions only

Length 2,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP24Q9UPU5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP24Q9UPU5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP24Q9UPU5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP24Q9UPU5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP24Q9UPU5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP24Q9UPU5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP24Q9UPU5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP24Q9UPU5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP24Q9UPU5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP24Q9UPU5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP24Q9UPU5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP24Q9UPU5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP24Q9UPU5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP24Q9UPU5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP24Q9UPU5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP24Q9UPU5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP24Q9UPU5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP24Q9UPU5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP24Q9UPU5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP24Q9UPU5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP24Q9UPU5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP24Q9UPU5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP24Q9UPU5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP24Q9UPU5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP24Q9UPU5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP24Q9UPU5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP24Q9UPU5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP24Q9UPU5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP24Q9UPU5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP24Q9UPU5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP24Q9UPU5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP24Q9UPU5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP24Q9UPU5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP24Q9UPU5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP24Q9UPU5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP24Q9UPU5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP24Q9UPU5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP24Q9UPU5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP24Q9UPU5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP24Q9UPU5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP24Q9UPU5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP24Q9UPU5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP24Q9UPU5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP24Q9UPU5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP24Q9UPU5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP24Q9UPU5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP24Q9UPU5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP24Q9UPU5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP24Q9UPU5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP24Q9UPU5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP24Q9UPU5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
USP24Q9UPU5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP24Q9UPU5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP24Q9UPU5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP24Q9UPU5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP24Q9UPU5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP24Q9UPU5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP24Q9UPU5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP24Q9UPU5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP24Q9UPU5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP24Q9UPU5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP24Q9UPU5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP24Q9UPU5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP24Q9UPU5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP24Q9UPU5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP24Q9UPU5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP24Q9UPU5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP24Q9UPU5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP24Q9UPU5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP24Q9UPU5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP24Q9UPU5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP24Q9UPU5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP24Q9UPU5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP24Q9UPU5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP24Q9UPU5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP24Q9UPU5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP24Q9UPU5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP24Q9UPU5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USP24Q9UPU5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP24Q9UPU5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP24Q9UPU5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USP24Q9UPU5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP24Q9UPU5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP24Q9UPU5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP24Q9UPU5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP24Q9UPU5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP24Q9UPU5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP24Q9UPU5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP24Q9UPU5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP24Q9UPU5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP24Q9UPU5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP24Q9UPU5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP24Q9UPU5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP24Q9UPU5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP24Q9UPU5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP24Q9UPU5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP24Q9UPU5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP24Q9UPU5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP24Q9UPU5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP24Q9UPU5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms