Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCAF8Q9UPN6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCAF8Q9UPN6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SCAF8Q9UPN6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SCAF8Q9UPN6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCAF8Q9UPN6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCAF8Q9UPN6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCAF8Q9UPN6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCAF8Q9UPN6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCAF8Q9UPN6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCAF8Q9UPN6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCAF8Q9UPN6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCAF8Q9UPN6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCAF8Q9UPN6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCAF8Q9UPN6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCAF8Q9UPN6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCAF8Q9UPN6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCAF8Q9UPN6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCAF8Q9UPN6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCAF8Q9UPN6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCAF8Q9UPN6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCAF8Q9UPN6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCAF8Q9UPN6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCAF8Q9UPN6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAF8Q9UPN6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAF8Q9UPN6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCAF8Q9UPN6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCAF8Q9UPN6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCAF8Q9UPN6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCAF8Q9UPN6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCAF8Q9UPN6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAF8Q9UPN6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAF8Q9UPN6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAF8Q9UPN6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCAF8Q9UPN6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCAF8Q9UPN6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCAF8Q9UPN6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCAF8Q9UPN6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SCAF8Q9UPN6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCAF8Q9UPN6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SCAF8Q9UPN6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCAF8Q9UPN6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCAF8Q9UPN6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCAF8Q9UPN6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCAF8Q9UPN6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCAF8Q9UPN6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SCAF8Q9UPN6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SCAF8Q9UPN6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SCAF8Q9UPN6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SCAF8Q9UPN6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCAF8Q9UPN6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCAF8Q9UPN6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAF8Q9UPN6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAF8Q9UPN6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAF8Q9UPN6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAF8Q9UPN6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAF8Q9UPN6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAF8Q9UPN6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAF8Q9UPN6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAF8Q9UPN6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAF8Q9UPN6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAF8Q9UPN6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAF8Q9UPN6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAF8Q9UPN6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAF8Q9UPN6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAF8Q9UPN6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SCAF8Q9UPN6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCAF8Q9UPN6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCAF8Q9UPN6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCAF8Q9UPN6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
SCAF8Q9UPN6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCAF8Q9UPN6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SCAF8Q9UPN6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SCAF8Q9UPN6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SCAF8Q9UPN6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAF8Q9UPN6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAF8Q9UPN6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAF8Q9UPN6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAF8Q9UPN6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAF8Q9UPN6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAF8Q9UPN6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCAF8Q9UPN6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCAF8Q9UPN6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SCAF8Q9UPN6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCAF8Q9UPN6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCAF8Q9UPN6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCAF8Q9UPN6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCAF8Q9UPN6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCAF8Q9UPN6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAF8Q9UPN6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAF8Q9UPN6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAF8Q9UPN6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAF8Q9UPN6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAF8Q9UPN6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAF8Q9UPN6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAF8Q9UPN6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAF8Q9UPN6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF8Q9UPN6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF8Q9UPN6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF8Q9UPN6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms