Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGA11Q9UKX5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGA11Q9UKX5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGA11Q9UKX5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGA11Q9UKX5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGA11Q9UKX5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGA11Q9UKX5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGA11Q9UKX5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGA11Q9UKX5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGA11Q9UKX5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGA11Q9UKX5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGA11Q9UKX5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGA11Q9UKX5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGA11Q9UKX5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGA11Q9UKX5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGA11Q9UKX5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGA11Q9UKX5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGA11Q9UKX5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGA11Q9UKX5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGA11Q9UKX5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGA11Q9UKX5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGA11Q9UKX5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGA11Q9UKX5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGA11Q9UKX5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGA11Q9UKX5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGA11Q9UKX5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGA11Q9UKX5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGA11Q9UKX5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGA11Q9UKX5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGA11Q9UKX5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGA11Q9UKX5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGA11Q9UKX5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGA11Q9UKX5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGA11Q9UKX5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGA11Q9UKX5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGA11Q9UKX5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGA11Q9UKX5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGA11Q9UKX5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGA11Q9UKX5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGA11Q9UKX5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGA11Q9UKX5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGA11Q9UKX5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
ITGA11Q9UKX5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGA11Q9UKX5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGA11Q9UKX5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGA11Q9UKX5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGA11Q9UKX5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGA11Q9UKX5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGA11Q9UKX5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA11Q9UKX5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA11Q9UKX5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA11Q9UKX5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA11Q9UKX5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ITGA11Q9UKX5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA11Q9UKX5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA11Q9UKX5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGA11Q9UKX5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGA11Q9UKX5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGA11Q9UKX5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGA11Q9UKX5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGA11Q9UKX5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGA11Q9UKX5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGA11Q9UKX5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGA11Q9UKX5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGA11Q9UKX5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGA11Q9UKX5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGA11Q9UKX5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGA11Q9UKX5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGA11Q9UKX5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGA11Q9UKX5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGA11Q9UKX5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGA11Q9UKX5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGA11Q9UKX5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGA11Q9UKX5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGA11Q9UKX5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGA11Q9UKX5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGA11Q9UKX5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGA11Q9UKX5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGA11Q9UKX5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGA11Q9UKX5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGA11Q9UKX5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGA11Q9UKX5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGA11Q9UKX5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGA11Q9UKX5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGA11Q9UKX5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGA11Q9UKX5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGA11Q9UKX5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGA11Q9UKX5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGA11Q9UKX5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGA11Q9UKX5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGA11Q9UKX5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGA11Q9UKX5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGA11Q9UKX5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGA11Q9UKX5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGA11Q9UKX5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGA11Q9UKX5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGA11Q9UKX5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGA11Q9UKX5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGA11Q9UKX5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGA11Q9UKX5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms