Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK13

ZNF221, Zinc finger protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF221Q9UK13 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF221Q9UK13 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF221Q9UK13 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF221Q9UK13 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF221Q9UK13 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF221Q9UK13 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF221Q9UK13 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF221Q9UK13 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF221Q9UK13 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF221Q9UK13 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF221Q9UK13 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF221Q9UK13 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF221Q9UK13 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF221Q9UK13 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF221Q9UK13 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF221Q9UK13 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF221Q9UK13 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF221Q9UK13 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF221Q9UK13 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF221Q9UK13 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF221Q9UK13 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF221Q9UK13 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF221Q9UK13 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF221Q9UK13 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF221Q9UK13 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF221Q9UK13 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF221Q9UK13 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF221Q9UK13 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF221Q9UK13 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF221Q9UK13 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF221Q9UK13 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF221Q9UK13 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF221Q9UK13 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF221Q9UK13 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF221Q9UK13 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF221Q9UK13 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF221Q9UK13 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF221Q9UK13 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF221Q9UK13 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF221Q9UK13 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF221Q9UK13 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF221Q9UK13 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF221Q9UK13 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZNF221Q9UK13 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZNF221Q9UK13 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZNF221Q9UK13 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF221Q9UK13 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF221Q9UK13 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF221Q9UK13 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF221Q9UK13 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF221Q9UK13 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF221Q9UK13 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF221Q9UK13 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF221Q9UK13 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF221Q9UK13 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF221Q9UK13 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF221Q9UK13 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF221Q9UK13 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ZNF221Q9UK13 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF221Q9UK13 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF221Q9UK13 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF221Q9UK13 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF221Q9UK13 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF221Q9UK13 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF221Q9UK13 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF221Q9UK13 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF221Q9UK13 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF221Q9UK13 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF221Q9UK13 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF221Q9UK13 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF221Q9UK13 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF221Q9UK13 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF221Q9UK13 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF221Q9UK13 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF221Q9UK13 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF221Q9UK13 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF221Q9UK13 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF221Q9UK13 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF221Q9UK13 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF221Q9UK13 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF221Q9UK13 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF221Q9UK13 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF221Q9UK13 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF221Q9UK13 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF221Q9UK13 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF221Q9UK13 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF221Q9UK13 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF221Q9UK13 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF221Q9UK13 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF221Q9UK13 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF221Q9UK13 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF221Q9UK13 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF221Q9UK13 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF221Q9UK13 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF221Q9UK13 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF221Q9UK13 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF221Q9UK13 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF221Q9UK13 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF221Q9UK13 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF221Q9UK13 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms