Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW3

DNMT3L, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3LQ9UJW3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNMT3LQ9UJW3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNMT3LQ9UJW3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DNMT3LQ9UJW3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNMT3LQ9UJW3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNMT3LQ9UJW3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNMT3LQ9UJW3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNMT3LQ9UJW3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNMT3LQ9UJW3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNMT3LQ9UJW3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNMT3LQ9UJW3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNMT3LQ9UJW3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNMT3LQ9UJW3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNMT3LQ9UJW3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNMT3LQ9UJW3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNMT3LQ9UJW3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNMT3LQ9UJW3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNMT3LQ9UJW3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
DNMT3LQ9UJW3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNMT3LQ9UJW3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNMT3LQ9UJW3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNMT3LQ9UJW3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNMT3LQ9UJW3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNMT3LQ9UJW3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNMT3LQ9UJW3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DNMT3LQ9UJW3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNMT3LQ9UJW3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNMT3LQ9UJW3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNMT3LQ9UJW3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNMT3LQ9UJW3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNMT3LQ9UJW3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNMT3LQ9UJW3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNMT3LQ9UJW3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNMT3LQ9UJW3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNMT3LQ9UJW3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNMT3LQ9UJW3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNMT3LQ9UJW3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNMT3LQ9UJW3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNMT3LQ9UJW3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNMT3LQ9UJW3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNMT3LQ9UJW3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNMT3LQ9UJW3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNMT3LQ9UJW3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNMT3LQ9UJW3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNMT3LQ9UJW3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNMT3LQ9UJW3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNMT3LQ9UJW3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNMT3LQ9UJW3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNMT3LQ9UJW3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNMT3LQ9UJW3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNMT3LQ9UJW3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
DNMT3LQ9UJW3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DNMT3LQ9UJW3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNMT3LQ9UJW3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNMT3LQ9UJW3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNMT3LQ9UJW3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
DNMT3LQ9UJW3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNMT3LQ9UJW3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNMT3LQ9UJW3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNMT3LQ9UJW3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNMT3LQ9UJW3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNMT3LQ9UJW3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNMT3LQ9UJW3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNMT3LQ9UJW3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNMT3LQ9UJW3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNMT3LQ9UJW3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNMT3LQ9UJW3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNMT3LQ9UJW3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNMT3LQ9UJW3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
DNMT3LQ9UJW3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
DNMT3LQ9UJW3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNMT3LQ9UJW3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNMT3LQ9UJW3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNMT3LQ9UJW3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNMT3LQ9UJW3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNMT3LQ9UJW3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNMT3LQ9UJW3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
DNMT3LQ9UJW3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNMT3LQ9UJW3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNMT3LQ9UJW3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNMT3LQ9UJW3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNMT3LQ9UJW3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNMT3LQ9UJW3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNMT3LQ9UJW3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNMT3LQ9UJW3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNMT3LQ9UJW3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNMT3LQ9UJW3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNMT3LQ9UJW3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNMT3LQ9UJW3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNMT3LQ9UJW3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNMT3LQ9UJW3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNMT3LQ9UJW3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNMT3LQ9UJW3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNMT3LQ9UJW3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNMT3LQ9UJW3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNMT3LQ9UJW3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNMT3LQ9UJW3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNMT3LQ9UJW3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNMT3LQ9UJW3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNMT3LQ9UJW3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms