Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CPA4Q9UI42 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CPA4Q9UI42 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CPA4Q9UI42 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CPA4Q9UI42 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CPA4Q9UI42 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CPA4Q9UI42 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CPA4Q9UI42 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CPA4Q9UI42 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CPA4Q9UI42 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CPA4Q9UI42 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CPA4Q9UI42 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CPA4Q9UI42 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CPA4Q9UI42 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CPA4Q9UI42 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CPA4Q9UI42 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CPA4Q9UI42 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CPA4Q9UI42 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CPA4Q9UI42 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CPA4Q9UI42 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CPA4Q9UI42 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CPA4Q9UI42 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CPA4Q9UI42 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CPA4Q9UI42 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CPA4Q9UI42 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CPA4Q9UI42 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CPA4Q9UI42 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CPA4Q9UI42 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CPA4Q9UI42 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CPA4Q9UI42 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CPA4Q9UI42 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CPA4Q9UI42 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CPA4Q9UI42 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CPA4Q9UI42 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CPA4Q9UI42 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CPA4Q9UI42 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CPA4Q9UI42 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CPA4Q9UI42 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CPA4Q9UI42 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CPA4Q9UI42 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CPA4Q9UI42 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CPA4Q9UI42 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CPA4Q9UI42 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CPA4Q9UI42 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CPA4Q9UI42 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CPA4Q9UI42 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CPA4Q9UI42 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CPA4Q9UI42 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CPA4Q9UI42 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CPA4Q9UI42 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CPA4Q9UI42 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CPA4Q9UI42 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CPA4Q9UI42 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CPA4Q9UI42 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CPA4Q9UI42 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CPA4Q9UI42 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CPA4Q9UI42 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CPA4Q9UI42 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CPA4Q9UI42 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CPA4Q9UI42 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CPA4Q9UI42 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CPA4Q9UI42 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CPA4Q9UI42 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CPA4Q9UI42 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CPA4Q9UI42 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CPA4Q9UI42 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CPA4Q9UI42 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CPA4Q9UI42 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CPA4Q9UI42 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CPA4Q9UI42 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CPA4Q9UI42 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CPA4Q9UI42 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CPA4Q9UI42 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CPA4Q9UI42 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CPA4Q9UI42 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CPA4Q9UI42 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CPA4Q9UI42 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CPA4Q9UI42 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CPA4Q9UI42 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CPA4Q9UI42 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CPA4Q9UI42 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CPA4Q9UI42 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CPA4Q9UI42 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CPA4Q9UI42 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CPA4Q9UI42 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CPA4Q9UI42 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CPA4Q9UI42 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CPA4Q9UI42 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CPA4Q9UI42 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CPA4Q9UI42 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CPA4Q9UI42 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CPA4Q9UI42 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CPA4Q9UI42 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CPA4Q9UI42 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CPA4Q9UI42 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CPA4Q9UI42 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CPA4Q9UI42 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CPA4Q9UI42 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CPA4Q9UI42 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CPA4Q9UI42 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms