Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SFMBT1Q9UHJ3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFMBT1Q9UHJ3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SFMBT1Q9UHJ3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SFMBT1Q9UHJ3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFMBT1Q9UHJ3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFMBT1Q9UHJ3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFMBT1Q9UHJ3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SFMBT1Q9UHJ3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SFMBT1Q9UHJ3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SFMBT1Q9UHJ3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SFMBT1Q9UHJ3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SFMBT1Q9UHJ3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SFMBT1Q9UHJ3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SFMBT1Q9UHJ3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SFMBT1Q9UHJ3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SFMBT1Q9UHJ3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SFMBT1Q9UHJ3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SFMBT1Q9UHJ3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFMBT1Q9UHJ3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFMBT1Q9UHJ3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFMBT1Q9UHJ3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFMBT1Q9UHJ3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFMBT1Q9UHJ3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFMBT1Q9UHJ3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SFMBT1Q9UHJ3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SFMBT1Q9UHJ3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SFMBT1Q9UHJ3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SFMBT1Q9UHJ3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SFMBT1Q9UHJ3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SFMBT1Q9UHJ3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFMBT1Q9UHJ3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFMBT1Q9UHJ3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFMBT1Q9UHJ3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFMBT1Q9UHJ3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFMBT1Q9UHJ3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFMBT1Q9UHJ3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFMBT1Q9UHJ3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFMBT1Q9UHJ3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFMBT1Q9UHJ3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFMBT1Q9UHJ3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFMBT1Q9UHJ3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFMBT1Q9UHJ3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SFMBT1Q9UHJ3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SFMBT1Q9UHJ3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SFMBT1Q9UHJ3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SFMBT1Q9UHJ3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SFMBT1Q9UHJ3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SFMBT1Q9UHJ3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SFMBT1Q9UHJ3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SFMBT1Q9UHJ3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFMBT1Q9UHJ3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFMBT1Q9UHJ3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFMBT1Q9UHJ3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFMBT1Q9UHJ3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFMBT1Q9UHJ3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFMBT1Q9UHJ3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SFMBT1Q9UHJ3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SFMBT1Q9UHJ3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SFMBT1Q9UHJ3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SFMBT1Q9UHJ3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SFMBT1Q9UHJ3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SFMBT1Q9UHJ3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SFMBT1Q9UHJ3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SFMBT1Q9UHJ3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SFMBT1Q9UHJ3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SFMBT1Q9UHJ3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SFMBT1Q9UHJ3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SFMBT1Q9UHJ3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SFMBT1Q9UHJ3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFMBT1Q9UHJ3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFMBT1Q9UHJ3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFMBT1Q9UHJ3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFMBT1Q9UHJ3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFMBT1Q9UHJ3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFMBT1Q9UHJ3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFMBT1Q9UHJ3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFMBT1Q9UHJ3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFMBT1Q9UHJ3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFMBT1Q9UHJ3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFMBT1Q9UHJ3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SFMBT1Q9UHJ3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SFMBT1Q9UHJ3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SFMBT1Q9UHJ3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SFMBT1Q9UHJ3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SFMBT1Q9UHJ3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SFMBT1Q9UHJ3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SFMBT1Q9UHJ3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFMBT1Q9UHJ3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFMBT1Q9UHJ3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFMBT1Q9UHJ3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SFMBT1Q9UHJ3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SFMBT1Q9UHJ3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SFMBT1Q9UHJ3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SFMBT1Q9UHJ3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SFMBT1Q9UHJ3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SFMBT1Q9UHJ3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.6 ms