Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH65

SWAP70, Switch-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWAP70Q9UH65 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SWAP70Q9UH65 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SWAP70Q9UH65 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SWAP70Q9UH65 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SWAP70Q9UH65 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SWAP70Q9UH65 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SWAP70Q9UH65 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SWAP70Q9UH65 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SWAP70Q9UH65 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SWAP70Q9UH65 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SWAP70Q9UH65 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SWAP70Q9UH65 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SWAP70Q9UH65 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SWAP70Q9UH65 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SWAP70Q9UH65 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SWAP70Q9UH65 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SWAP70Q9UH65 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SWAP70Q9UH65 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SWAP70Q9UH65 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SWAP70Q9UH65 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SWAP70Q9UH65 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SWAP70Q9UH65 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SWAP70Q9UH65 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SWAP70Q9UH65 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SWAP70Q9UH65 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SWAP70Q9UH65 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SWAP70Q9UH65 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SWAP70Q9UH65 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SWAP70Q9UH65 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SWAP70Q9UH65 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SWAP70Q9UH65 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SWAP70Q9UH65 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SWAP70Q9UH65 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SWAP70Q9UH65 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SWAP70Q9UH65 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SWAP70Q9UH65 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SWAP70Q9UH65 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SWAP70Q9UH65 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SWAP70Q9UH65 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SWAP70Q9UH65 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SWAP70Q9UH65 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SWAP70Q9UH65 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SWAP70Q9UH65 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SWAP70Q9UH65 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SWAP70Q9UH65 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SWAP70Q9UH65 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SWAP70Q9UH65 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SWAP70Q9UH65 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SWAP70Q9UH65 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SWAP70Q9UH65 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SWAP70Q9UH65 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SWAP70Q9UH65 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SWAP70Q9UH65 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SWAP70Q9UH65 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SWAP70Q9UH65 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SWAP70Q9UH65 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SWAP70Q9UH65 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SWAP70Q9UH65 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SWAP70Q9UH65 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SWAP70Q9UH65 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SWAP70Q9UH65 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SWAP70Q9UH65 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SWAP70Q9UH65 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SWAP70Q9UH65 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SWAP70Q9UH65 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SWAP70Q9UH65 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SWAP70Q9UH65 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SWAP70Q9UH65 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SWAP70Q9UH65 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SWAP70Q9UH65 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SWAP70Q9UH65 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SWAP70Q9UH65 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SWAP70Q9UH65 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SWAP70Q9UH65 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SWAP70Q9UH65 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SWAP70Q9UH65 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SWAP70Q9UH65 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SWAP70Q9UH65 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SWAP70Q9UH65 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SWAP70Q9UH65 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SWAP70Q9UH65 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SWAP70Q9UH65 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SWAP70Q9UH65 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SWAP70Q9UH65 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SWAP70Q9UH65 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SWAP70Q9UH65 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SWAP70Q9UH65 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SWAP70Q9UH65 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SWAP70Q9UH65 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SWAP70Q9UH65 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SWAP70Q9UH65 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SWAP70Q9UH65 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SWAP70Q9UH65 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SWAP70Q9UH65 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SWAP70Q9UH65 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SWAP70Q9UH65 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SWAP70Q9UH65 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SWAP70Q9UH65 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SWAP70Q9UH65 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SWAP70Q9UH65 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms