Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CLIP2Q9UDT6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CLIP2Q9UDT6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CLIP2Q9UDT6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CLIP2Q9UDT6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CLIP2Q9UDT6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLIP2Q9UDT6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLIP2Q9UDT6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLIP2Q9UDT6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLIP2Q9UDT6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLIP2Q9UDT6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLIP2Q9UDT6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLIP2Q9UDT6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLIP2Q9UDT6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLIP2Q9UDT6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLIP2Q9UDT6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLIP2Q9UDT6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLIP2Q9UDT6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLIP2Q9UDT6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLIP2Q9UDT6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLIP2Q9UDT6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLIP2Q9UDT6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLIP2Q9UDT6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLIP2Q9UDT6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLIP2Q9UDT6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLIP2Q9UDT6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLIP2Q9UDT6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLIP2Q9UDT6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLIP2Q9UDT6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLIP2Q9UDT6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLIP2Q9UDT6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLIP2Q9UDT6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLIP2Q9UDT6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLIP2Q9UDT6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLIP2Q9UDT6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLIP2Q9UDT6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLIP2Q9UDT6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CLIP2Q9UDT6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLIP2Q9UDT6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLIP2Q9UDT6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLIP2Q9UDT6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CLIP2Q9UDT6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLIP2Q9UDT6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLIP2Q9UDT6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLIP2Q9UDT6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLIP2Q9UDT6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLIP2Q9UDT6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLIP2Q9UDT6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CLIP2Q9UDT6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLIP2Q9UDT6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CLIP2Q9UDT6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLIP2Q9UDT6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLIP2Q9UDT6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLIP2Q9UDT6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLIP2Q9UDT6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLIP2Q9UDT6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLIP2Q9UDT6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLIP2Q9UDT6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLIP2Q9UDT6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLIP2Q9UDT6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLIP2Q9UDT6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLIP2Q9UDT6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLIP2Q9UDT6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CLIP2Q9UDT6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLIP2Q9UDT6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLIP2Q9UDT6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLIP2Q9UDT6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLIP2Q9UDT6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLIP2Q9UDT6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLIP2Q9UDT6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLIP2Q9UDT6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLIP2Q9UDT6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLIP2Q9UDT6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLIP2Q9UDT6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLIP2Q9UDT6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLIP2Q9UDT6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLIP2Q9UDT6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLIP2Q9UDT6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLIP2Q9UDT6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLIP2Q9UDT6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLIP2Q9UDT6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLIP2Q9UDT6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLIP2Q9UDT6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CLIP2Q9UDT6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLIP2Q9UDT6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLIP2Q9UDT6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLIP2Q9UDT6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLIP2Q9UDT6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLIP2Q9UDT6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLIP2Q9UDT6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLIP2Q9UDT6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLIP2Q9UDT6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLIP2Q9UDT6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLIP2Q9UDT6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CLIP2Q9UDT6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CLIP2Q9UDT6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLIP2Q9UDT6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CLIP2Q9UDT6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLIP2Q9UDT6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLIP2Q9UDT6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms