Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS7AQ9UBW8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS7AQ9UBW8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS7AQ9UBW8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS7AQ9UBW8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS7AQ9UBW8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS7AQ9UBW8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPS7AQ9UBW8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPS7AQ9UBW8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPS7AQ9UBW8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPS7AQ9UBW8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPS7AQ9UBW8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPS7AQ9UBW8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPS7AQ9UBW8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPS7AQ9UBW8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPS7AQ9UBW8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPS7AQ9UBW8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
COPS7AQ9UBW8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPS7AQ9UBW8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPS7AQ9UBW8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPS7AQ9UBW8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPS7AQ9UBW8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPS7AQ9UBW8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPS7AQ9UBW8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPS7AQ9UBW8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPS7AQ9UBW8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPS7AQ9UBW8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPS7AQ9UBW8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPS7AQ9UBW8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPS7AQ9UBW8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPS7AQ9UBW8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
COPS7AQ9UBW8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPS7AQ9UBW8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPS7AQ9UBW8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPS7AQ9UBW8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPS7AQ9UBW8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPS7AQ9UBW8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPS7AQ9UBW8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
COPS7AQ9UBW8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPS7AQ9UBW8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPS7AQ9UBW8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPS7AQ9UBW8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPS7AQ9UBW8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPS7AQ9UBW8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPS7AQ9UBW8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPS7AQ9UBW8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPS7AQ9UBW8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPS7AQ9UBW8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPS7AQ9UBW8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPS7AQ9UBW8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPS7AQ9UBW8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPS7AQ9UBW8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPS7AQ9UBW8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPS7AQ9UBW8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPS7AQ9UBW8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPS7AQ9UBW8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPS7AQ9UBW8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPS7AQ9UBW8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPS7AQ9UBW8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPS7AQ9UBW8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPS7AQ9UBW8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPS7AQ9UBW8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPS7AQ9UBW8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPS7AQ9UBW8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPS7AQ9UBW8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPS7AQ9UBW8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPS7AQ9UBW8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
COPS7AQ9UBW8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
COPS7AQ9UBW8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
COPS7AQ9UBW8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPS7AQ9UBW8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPS7AQ9UBW8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPS7AQ9UBW8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
COPS7AQ9UBW8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPS7AQ9UBW8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPS7AQ9UBW8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPS7AQ9UBW8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPS7AQ9UBW8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPS7AQ9UBW8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPS7AQ9UBW8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPS7AQ9UBW8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPS7AQ9UBW8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COPS7AQ9UBW8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPS7AQ9UBW8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPS7AQ9UBW8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPS7AQ9UBW8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPS7AQ9UBW8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPS7AQ9UBW8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COPS7AQ9UBW8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPS7AQ9UBW8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPS7AQ9UBW8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPS7AQ9UBW8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPS7AQ9UBW8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COPS7AQ9UBW8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPS7AQ9UBW8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPS7AQ9UBW8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPS7AQ9UBW8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPS7AQ9UBW8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPS7AQ9UBW8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPS7AQ9UBW8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
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